UNIWIN - Analyse Procrustéenne Généralisée

L’analyse procrustéenne généralisée (GPA) est une technique mathématique permettant de comparer des formes. Elle est utilisée pour déformer un objet afin de le rendre autant que faire se peut semblable à une référence, ne laissant apparaître entre l’objet et la référence que les différences que les transformations (rotation, translation et mise à l’échelle) n’ont pu gommer. La déformation supprime les différences qui ne sont pas dues à la forme intrinsèque de l’objet. Celles qui subsistent sont donc considérées objectives, et permettent d’évaluer le degré de ressemblance entre l’objet et la référence.

Cette technique a été nommée ainsi à partir de Procruste, un bandit de la mythologie grecque qui forçait ses victimes à s’allonger sur un lit et modifiait violemment leur taille pour que celle-ci corresponde à la taille du lit.

L’analyse procrustéenne généralisée est utilisée dans tous les champs où l’analyse de formes peut être utile : analyse sensorielle, biologie, archéologie, médecine.

Cette procédure est basée sur le package R ‘shapes’.

Tableaux

Distances initiales entre les configurations

Distances finales entre les configurations

Configurations finales (observations)

Configurations finales (configurations)

Consensus

Distances au consensus

Inerties ACP (observations)

Inerties ACP (configurations)

Corrélations des variables

Scores du consensus

Scores des observations x configurations

Scores des configurations

Graphiques

Distances des configurations au consensus

Corrélations des variables x configurations (points)

Corrélations des variables x configurations (points + lignes)

Plan factoriel du consensus des observations

Plan factoriel des observations x configurations

Plan factoriel des configurations